Применение препарата целесообразно для удаления как многолетних, так и однолетних растений, злаковых или двудольных. Агрокиллер справится с пыреем ползучим, щавлем, осотом, вьюнком и многими другими сорняками. Его раствором опрыскивают сорняки до смачивания листовой поверхности. Соседствующие культурные растения необходимо защитить от попадания препарата пленкой или фанерой.

Оптимальная температура воздуха для воздействия препаратов составляет от 15 до 25С. При температуре 5С,  действие замедляется. Агрокиллер можно применять за 1–2 недели до наступления первых заморозков. Даже после заморозков гербициды действуют, хоть медленно, но не менее эффективно, если к моменту опрыскивания побурение вегетативной массы сорняков вследствие холодов составляет менее 25%

Попадание небольшого количества ила, тины или грязи в рабочий раствор глифосата также приводит к существенному ущербу. Для Агрокиллера характерна чрезвычайно высокая способность связываться с частицами почвы, при этом адсорбированное действующее вещество теряет свою гербицидную активность. Этим, кстати, объясняется успешная практика довсходового использования глифосатов – почва надежно связывает попавший на нее препарат и исключает фитотоксическое действие препарата на всходы